1以系統論視角認識審計整改工作機制的整體性
新修改的審計法增加規定了審計整改相關方的責任，從系統視角看，審計機關、被審計單位、政府和主管機關單位，以及社會公眾，都是審計整改這一系統的參與者，構成了整改工作的運轉系統，主要包括審計查出問題整改機制、整改督促檢查機制、整改結果報告機制。對內部審計而言，可以借鑒審計法的規定，從系統論視角推動建立企業內部的審計整改工作機制，這也有助于促進企業履行好作為國家審計被審計單位的整改主體責任。在分清責任的基礎上，內部審計要以系統論視角，從整體性出發，將督促檢查審計整改工作放在審計整改工作系統中進行思考，設計好督促檢查審計整改的流程、方式和發力點，才能更為精準、有效地推動審計整改工作。
2以系統論視角認識督促檢查審計整改在審計業務完整鏈條上的地位
系統論理論在企業管理中應用的一個基本方法就是PDCA循環，即計劃（Plan）、執行（Do）、檢查（Check）、調整（Action，也有一說是Adjustment），各項業務管理按照作出計劃、計劃實施、檢查實施效果，然后根據檢查結果做出調整，未解決問題啟動下一輪循環去解決。審計業務管理同樣適用PDCA循環。審計項目經常狹義的被誤認為從計劃開始到審計報告印發為止。經過審計實踐，審計發現問題整改的督促檢查情況，不斷得到強化，成為審計業務（系統）鏈條中的重要一環。形成了從審計計劃（P）、審計實施和報告（D）、督促整改以檢查審計實施效果（C）、通過落實整改進一步強化責任并規范管理（A）的審計業務鏈條。再根據整改結果作出新一輪審計計劃（P），開始新的PDCA循環。
3以系統論視角認識督促檢查審計整改對于完善風險導向審計的價值
風險導向審計是以風險為邏輯起點，風險評估為重心，從審計計劃的制訂、審計對象的選擇到審計項目的推進，每一步都體現著評估風險、揭示風險、推動防范化解風險的理念。審計報告揭示的問題，是被審計單位現實或潛在風險。對整改情況進行跟蹤，本身就是對風險的跟蹤，是風險導向審計原理的運用。審計方跟蹤整改結果、評估防范化解風險的情況，研判風險事項和領域新的管控情況，據此調整計劃審計的重點單位、重點環節和重點領域。對已經整改的單位、領域，可以在審計計劃中適當減少審計監督的頻次和覆蓋面，但對依然具有一定甚至較大風險的單位和領域，應當增加審計頻次和覆蓋面。以風險為導向，從審計計劃、審計實施、監督檢查整改、推動落實整改，再到新一輪審計計劃，內部審計工作形成了更為完善的以終為始的閉環。
1從整體性出發構建審計查出問題整改的組織運行機制
做好審計整改工作，就要構建主體明確、責任清晰、履責有力、問責有效的責任體系。內部審計作為落實構建這一責任體系的主要推動者，要從系統性視角，強化對審計查出問題整改工作的引領和管理。要推動強化審計整改工作的組織領導，由企業主要領導牽頭組成整改工作領導小組。要配備有一定審計經驗的內審人員，組成強有力的審計整改工作團隊。要將近年審計查出的各所屬單位的問題進行全面匯總和多維度分析。要督促有關部門、單位指定專人負責審計整改工作。把審計整改責任、督導責任細化分解到具體單位和個人，推動建立集中領導、全貌研究、整體部署、集中管理、責任到人的審計整改工作機制。
2對審計整改工作進行系統性分析，從問題產生根源上推進整改
內部審計在督促檢查審計整改中不能孤立地看待審計查出的問題和對問題的整改，要將其放到所屬經營管理領域甚至是集團公司整體經營管理的大系統中進行分析，在結合問題產生的根本原因、研判分析風險的基礎上推進審計整改，分析出問題整改困難的根本性、深層次的原因，這樣才能真正找到整改的突破環節，使督促審計整改工作更有效。
3根據審計查出問題的整改情況，進行后續審計和專項審計
審計查出問題反映了所在單位管理的薄弱環節，屬于審計已經識別出來的風險。要結合整改情況的檢查，對后續風險進行分析和評估。在審計查出的具有一定代表性、已持續一段時間或者屢查屢犯的問題，可以針對出現這些問題的領域，擴大審計范圍，選取更多單位安排專項審計，以便反映問題全貌、深挖癥結，更有針對性、更全面地進行整改。
4將督促檢查審計整改工作納入內部審計計劃，與審計項目實現統籌安排
應當把督促檢查審計整改工作納入年度審計計劃，與各審計項目銜接配合、統籌安排、一并實施。在計劃中，除安排內部審計機構對審計整改情況進行監督檢查，針對整改情況實施后續審計外，還應該安排有針對性的工作，創新督促檢查審計整改的方式方法。
5審計與被審計雙方統一認識，提高被審計單位主動整改的積極性
內部審計對被審計單位自查自糾或審計查出后已整改的問題可以不再寫入審計報告，或者在審計報告中說明被審計單位已整改情況，以此鼓勵被審計單位主動整改，有效地降低風險、減少損失，這本身就是審計的出發點。
6科學分類施策，系統性規劃審計查出問題的整改路線圖
對于審計查出的問題，一些可以“立行立改”立刻糾正，這樣的問題往往整改標準比較明確、整改路徑比較清晰。一些問題的整改復雜程度較高，需要一定的時間逐步整改。還有一些問題，已經是既成事實，出現了風險甚至損失，或是一些行為違反了國家法規。這些問題的整改，一方面需要分析過錯，分清責任適當懲戒，另一方面找準癥結、吸取教訓，提高管理和工作水平。只有將審計發現問題的點放到其所屬的業務系統當中，具體問題具體分析，采取分類施策的辦法，才能制定出科學合理的整改路徑、時限和標準。
7將審計整改情況與組織和個人考核緊密聯系有機結合
對部門單位和員工進行考核有利于實現員工績效和企業戰略目標的有機統一，而考核和激勵懲戒是一個聯動產生效果的系統。將審計整改工作情況納入考核體系，能夠更有效激發整改的動力。內部審計要根據企業授權，協助或直接參與到對審計整改的考核工作中來。
8將審計查出問題的糾正處理與責任追究工作統籌安排緊密銜接
對審計查出問題進行責任追究與對審計整改不力進行責任追究，又是在責任追究方面兩個相互關聯、相關促進的統一體。這就要求內部審計不僅要督促追究審計查出問題責任人的責任，也要督促追究拒不整改或整改不力人員的責任，切實維護審計整改的嚴肅性。在推進審計查出問題糾正處理與責任追究相結合的過程中，內部審計機構還應當按照11號令的要求“加強與內部紀檢監察、巡視巡察、組織人事等其他內部監督力量的協作配合，建立信息共享、結果共用、重要事項共同實施、問題整改問責共同落實等工作機制。”